Um antigo aluno de Dana Scully pede a sua ajuda para resolver alguns estranhos desaparecimentos: pessoas que desaparecem deixando somente algumas marcas chamuscadas no lugar. Mulder e Scully perseguem um cientista cuja sombra tornou-se uma terrível arma como resultado de um acidente de laboratório. Mas a equipa dos Ficheiros Secretos não é a única a perseguir o cientista, e Mulder vai contra o seu próprio aliado numa tentativa de evitar que este segredo caia em mãos erradas.