O pedopsiquiatra, que desde 1997 colaborava com a Casa Pia e que encaminhou para a instituição o jovem que é agora a principal testemunha do processo em julgamento, demitiu-se da Comissão de Apoio Psicológico para a Intervenção em Crise em Fevereiro de 2005, por a juíza Ana Peres ter decidido manter a realização de novas perícias psicológicas às alegadas vítimas.

Na altura, Pedro Strecht anunciou "com tristeza" a "decisão irreversível" de se demitir, mas em carta dirigida ao então ministro da Segurança Social, da Criança e da Família Fernando Negrão garantiu que iria manter o seu trabalho de suporte e intervenção junto a cada um dos jovens que dava acompanhamento especializado.

Na missiva, o pedopsiquiatra explicava que ao longo de mais de dois anos avaliou e prestou apoio médico especializado a dezenas de crianças e adolescentes "vítimas de horríveis crimes de abuso sexual", e defendia a credibilidade dos depoimentos dos jovens.

No entanto, esta posição do médico é contestada por algumas defesas dos arguidos, designadamente a do apresentador de televisão Carlos Cruz, que questionou por que motivo, tendo Pedro Strecht seguido alguns alunos casapianos desde 1997, é que só depois de rebentar o escândalo, em Novembro de 2002, detectou situações de abusos sexuais.