Todos os dias Brain tem um plano genial para dominar o mundo... e todos os dias o plano vai por água abaixo!
Pinky e Brain são dois ratos de laboratório geneticamente melhorados que residem numa gaiola no centro de pesquisa Acme Labs. Cérebro é egocêntrico e intriguista; Pinky é de boa índole, mas muito longe da genialidade de Brain. Em cada episódio, Brain elabora um novo plano para dominar o mundo que, invariavelmente, termina em fracasso, seja devido à idiotice de Pinky, a impraticabilidade do plano de Brain, a própria arrogância de Brain, ou simplesmente porque as situações ficam fora de controlo...